Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC051665E9Q623 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC051665E9Q623 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms