Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde8bE9Q4S1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms