Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
ApobE9Q414 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
ApobE9Q414 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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