Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzd2E9Q1M1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pdzd2E9Q1M1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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