Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Myo5cE9Q1F5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myo5cE9Q1F5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms