Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx60E9PZQ1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
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Ddx60E9PZQ1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Ddx60E9PZQ1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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