Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim30bE9PVL6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim30bE9PVL6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms