Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Vpreb3D3Z6J4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms