Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms