Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms