Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms