Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cfap70D3YVL2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms