Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf11bB4XVQ1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms