Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms