Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm5483B2RV77 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5483B2RV77 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms