Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Otud7bB2RUR8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Otud7bB2RUR8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms