Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usf3B2RUQ2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Usf3B2RUQ2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usf3B2RUQ2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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