Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AU015836B2RUM3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AU015836B2RUM3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AU015836B2RUM3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AU015836B2RUM3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms