Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prrt4B2RU40 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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