Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ythdc2B2RR83 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ythdc2B2RR83 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms