Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Arhgap42B2RQE8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms