Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Uhrf1bp1B2KF50 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms