Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Brpf3B2KF05 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brpf3B2KF05 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms