Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pramef20B1ARV6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pramef20B1ARV6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms