Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CatsperbA2RTF1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CatsperbA2RTF1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 481.6 ms