Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Itga8A2ARA8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Itga8A2ARA8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms