Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SktA2AQ25 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms