Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Scn1aA2APX8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn1aA2APX8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms