Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ttll9A2APC3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ttll9A2APC3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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