Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Syndig1A2ANU3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms