Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Lcn6A2AJB9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lcn6A2AJB9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms