Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grin3aA2AIR5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms