Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Frmpd4A2AFR3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Frmpd4A2AFR3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms