Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm16A2A935 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms