Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm5538W4VSP6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5538W4VSP6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Gm5538W4VSP6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5538W4VSP6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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