Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Hdac6Q9Z2V5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Hdac6Q9Z2V5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Hdac6Q9Z2V5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Hdac6Q9Z2V5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hdac6Q9Z2V5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hdac6Q9Z2V5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Hdac6Q9Z2V5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Hdac6Q9Z2V5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Hdac6Q9Z2V5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hdac6Q9Z2V5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Hdac6Q9Z2V5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hdac6Q9Z2V5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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