Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl40Q9Z2Q5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms