Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Crlf3Q9Z2L7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms