Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfkbiaQ9Z1E3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms