Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Sh3bp5Q9Z131 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Sh3bp5Q9Z131 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Sh3bp5Q9Z131 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Sh3bp5Q9Z131 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Sh3bp5Q9Z131 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Sh3bp5Q9Z131 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bp5Q9Z131 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Sh3bp5Q9Z131 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Sh3bp5Q9Z131 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Sh3bp5Q9Z131 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Sh3bp5Q9Z131 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Sh3bp5Q9Z131 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp5Q9Z131 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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