Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NgfrQ9Z0W1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NgfrQ9Z0W1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms