Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cldn13Q9Z0S4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cldn13Q9Z0S4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cldn13Q9Z0S4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cldn13Q9Z0S4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Cldn13Q9Z0S4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn13Q9Z0S4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn13Q9Z0S4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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