Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms