Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabbr1Q9WV18 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms