Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms