Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpv2Q9WTR1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms