Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Psma4Q9R1P0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms