Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcm1Q9R0L6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcm1Q9R0L6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms