Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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