Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Npas3Q9QZQ0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms